El pequeño Museo Regional de Arqueología Maya en el corazón de la ciudad se siente tan mohoso como su edificio de la década de 1970 y la mayoría de las descripciones están solo en español, pero contiene muchos tesoros de la región.
Las esculturas de jade, los pedernales de obsidiana con caras talladas y la cerámica dan una idea de lo que había dentro de muchas de las grandes estructuras en las zonas arqueológicas. Las ollas de incienso de cerámica están decoradas con imágenes de los gobernantes de Copán.
Lo más destacado es una reproducción de la tumba completa de un chamán, tal como se encontró en el cercano sitio de Las Sepulturas. Contenía piezas de cerámica, conchas marinas, cráneos y los restos de un jaguar sacrificado.